В преддверии торжественного собрания ректорат вывесил объявление с подробным описанием наказаний, которые ждут тех, кто будет нарушать общественное спокойствие. Это разозлило студентов, они освистали выступление ректора, а после двинулись на Невский проспект, где каждый год традиционно собирались неформальные шествия в честь годовщины основания университета. Полиция перекрыла Дворцовый мост, чтобы не дать толпе молодых людей выйти на проспект, начались столкновения, в ход пошли нагайки — от которых пострадали не только студенты, но и случайные прохожие.
На следующий день возмущенные произошедшим студенты собрались в университете на сходку и постановили его «закрыть», пока власти не гарантируют им личную неприкосновенность. Занятия фактически прекратились, началась стачка, и через несколько дней правительство вместо каких-либо уступок отправили в университет полицейских, которые занялись арестами — иногородних бунтарей выслали на родину, остальных отдали на поруки. В знак солидарности с петербургским студенчеством около 25000 молодых людей из других высших учебных заведений от Москвы до Варшавы также объявили забастовку, требуя личной неприкосновенности и академических свобод.
Студенческие выступления в Московском университете начались на следующий день после сходки петербуржцев и также окончились массовыми арестами и даже самоубийством одного из бунтовщиков в Бутырской тюрьме.
Волнения улеглись лишь к осени. Большинство студентов, включая Иоффе, были впоследствии восстановлены, однако организаторам протеста путь в университет был закрыт. Многие из них затем примкнули к революционному движению и активно участвовали в событиях 1905 и 1917 годов.