Поэтому в этой области широко распространен такой термин, как operational taxonomic units, или OTU, — таксономические группы бактерий, достаточно родственные между собой, чтобы их можно было объединить на основании сходства ДНК.
Порог сходства ставят обычно на уровне 97 процентов — примерно настолько же похожи между собой 18S РНК человека и вомбата. Это удобные рабочие единицы, которые могут не совпадать с традиционными видами, но тем не менее позволяют исследователям описывать многообразие бактерий в образце, в том числе и ранее неизвестных.